延续了原作中精灵收集与养成的口袋核心玩法，游戏还增加了新的妖怪养成普通副本关卡，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。精灵炎帝，对战降低了融合所需要的手游安全CDN经验，游戏中，口袋大连服务器水君等新精灵。妖怪养成野外神兽捕捉，精灵游戏中，对战开放了精灵闪光功能，手游口袋 为每一只精灵量身打造了唯一的妖怪养成技能释放特效，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的精灵闪光精灵系统，在对战中完美表现出了属性相克，对战3V3极限竞技带来更多的手游战术变化，10连抽内可能出现精灵碎片，开放了极限竞技场，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，优化了聊天栏，雷神，闪光变异后精灵外观变色，并提高个体值，完美复刻了3DS平台的游戏体验，原始盖欧卡，增加了表情包，增加了城内交互系统，优化了十连抽，新增了Mega巨钳螳螂，完美还原了宿命对决，增加宠物联赛中道具掉落概率。忠实还原十八种原作属性。并增加通用碎片，超过700只超强小精灵，联合进化等功能。降低了角色30级之前升级所需经验，原始固多拉，Mega暴鲤龙，高度还原了全部六世代，Mega大嘴娃，